《许叔微伤寒论著三种》分为《伤寒百证歌》《伤寒发微论》《伤寒九十论》三部分，点校的底本分别为：《伤寒百证歌》底本为清光绪七年吴兴陆氏十万卷楼丛书本、清咸丰二年壬子藏修书屋刻本；《伤寒发微论》底本为清光绪七年吴兴陆氏十万卷楼丛书本；《伤寒九十论》底本为清成丰三年癸丑木活字排印琳琅秘室丛书本。三部分的主校本为1956年商务印书馆出版的《许叔微伤寒论著三种》，参校本为l993年人民卫生出版社出版的《许叔微伤寒论著三种》和2006年中国中医药出版社出版的《许叔微医学全书》。
  　　点校的方式：原书繁体字改为简体字，通假字和异体字原则上径改，特殊情况者予以保留。竖排变横排。原书的“右”改作“上”，并根据读者阅读习惯，加以标点符号。原书中的错漏之处径改之。需要告知读者的是，许叔微原著中所引用的《伤寒论》《金匮要略》等原文，因其采用的版本不同，与现行通用的赵开美版有个别文字的差异，我们尊重许叔微所引用的原文以及许叔微所作所写，除非明显错字之处，一般不做改动。
  
  伤寒百证歌
  卷一
  证·伤寒脉证总论歌
  第二证·伤寒病证总类歌
  第三证·表证歌
  第四证·里证歌
  第五证·表里寒热歌
  第六证·表里虚实歌
  第七证·急救表里歌
  第八证·无表里证歌
  第九证·表里水证歌
  第十证·表里两证俱见歌
  第十一证·三阴三阳传人歌
  第十二证·阴阳两感歌
  第十三证·阳证阳毒歌
  第十四证·阴证阴毒歌
  第十五证·太阳阳明合病歌
  第十六证·太阳少阳合病歌
  第十七证·三阳合病歌
  第十八证-太阳少阳并病歌
  第十九证·阴证似阳歌
  第二十证·阳证似阴歌
  
  卷二
  第二十一证·阴盛隔阳歌
  第二十二证·阴阳易歌
  第二十三证·伤寒歌
  第二十四证·中风歌
  第二十五证·伤寒见风脉、中风见寒脉歌
  第二十六证·热病中喝歌
  第二十七证·五种温歌
  第二十八证·三种湿歌
  第二十九证·两种痉歌
  第三十证·四证似伤寒歌
  第三十一证·可汗不可汗歌
  第三十二证·可下不可下歌
  第三十三证·可吐不可吐歌
  第三十四证·可火不可火歌
  第三十五证·可水不可水歌
  第三十六证·可灸不可灸歌
  第三十七证·可针不可针歌
  ……
  伤寒发微论
  伤寒九十论